Nhằm đảm bảo cho phiên toà diễn ra an toàn, ngay từ khu vực cổng, chỉ những người có giấy triệu tập của toà mới được vào khu vực xét xử. Bên trong sảnh, lực lượng cảnh sát cơ động, nhân viên bảo vệ toà án và lực lượng y tế đã túc trực rất đông. Trong phòng tác nghiệp dành riêng cho báo chí, có gần 100 phóng viên các cơ quan thông tấn, báo chí trên địa bàn TP.HCM đang tích cực tác nghiệp. Để tạo điều kiện cho phóng viên đưa tin, toà án nhân dân TP.HCM bố trí phòng riêng, cho phép sử dụng wifi trong quá trình tác nghiệp, được theo dõi phiên toà xuyên suốt thời gian diễn ra thông qua màn hình trực tuyến, nhưng phải tuân thủ các quy định của phiên toà.

Để đảm bảo hơn 400 người tham dự, toà án nhân dân TP.HCM đã nối thông 2 phòng xử lớn nhất, bố trí đủ chỗ ngồi cho các bị cáo, luật sư và người có quyền lợi nghĩa vụ liên quan. Vụ án sẽ được xét xử trực tiếp tại trụ sở tòa án và kết hợp truyền dẫn hình ảnh, âm thanh tại điểm cầu trại giam Chí Hoà, thuộc CA TP.HCM. Hội đồng xét xử sẽ xét hỏi, thẩm tra đối với từng nhóm tội danh, nhóm hành vi. Khi đến lịch thẩm tra, xét hỏi đối với nhóm các bị cáo nào thì sẽ được trích xuất, dẫn giải đến tòa để thẩm vấn trực tiếp, các bị cáo thuộc nhóm còn lại sẽ được theo dõi phiên xử qua đường truyền.

Theo cáo trạng, trong thời gian giữ chức Cục trưởng, bị cáo Trần Kỳ Hình đã không xử lý các sai phạm mà còn nhận tiền hối lộ để bỏ qua các sai phạm trong việc cấp phép đủ điều kiện hoạt động trung tâm đăng kiểm hơn 7,1 tỉ đồng. Ông Hình còn lợi dụng chức vụ quyền hạn khi duyệt cấp thông báo năng lực cho 63 hồ sơ cơ sở đóng tàu không đủ điều kiện.

Sau khi ông Hình về hưu, người kế nhiệm là bị cáo Đặng Việt Hà vì vụ lợi cá nhân đã nâng mức hưởng lợi của mình phải là cao nhất trong số tiền sai phạm mà cán bộ tại các trung tâm đăng kiểm nhận được. Đặng Việt Hà phải chịu trách nhiệm hình sự chung về số tiền nhận hối lộ 40,2 tỉ đồng, hưởng lợi gần 9 tỉ đồng. Liên quan sai phạm, quyền Trưởng phòng VAR Trần Anh Quân nhận tổng cộng 60,7 tỉ đồng. Ngoài việc có nhiệm vụ đưa hối lộ cho lãnh đạo Cục, Quân trở thành người hưởng lợi nhiều nhất trong đại án đăng kiểm với số tiền hơn 11,7 tỉ đồng.